Разработанный алгоритм позволяет предсказать, какие типы Т-клеточных рецепторов активируются после введения антигена
Российские ученые вместе с коллегами из Франции разработали алгоритм, позволяющий узнать, какую реакцию даст организм после введения возбудителя заболевания. Новый метод определяет, какие типы Т-клеточных рецепторов (ТКР) активируются при заражении человека тем или иным вирусом.
В основу алгоритма легли выводы, сделанные в результате длительного изучения нескольких пар близнецов после введения в их организмы вакцины от желтой лихорадки.
Т-клеточные рецепторы представляют собой белковые комплексы на поверхности Т-лимфоцитов. Они состоят из нескольких молекул, которые кодируются несколькими генами. ТКР взаимодействуют с антигенами, при этом если антиген и Т-рецептор подходят друг другу, то последний активирует клетку и запускает иммунный ответ.
Чтобы разработать эффективную вакцину, ученым важно знать набор Т-клеточных рецепторов, реагирующих на интересующий специалиста антиген. Иммунологи из России и Франции попытались автоматизировать анализ набора Т-рецепторов и найти закономерности, по которым он может меняться.
Для этого они предложили трем парам однояйцевых близнецов пройти вакцинацию против желтой лихорадки. Данное заболевание распространено в странах Африки и Южной Америки и вызывается вирусом, переносимым комарами.
За неделю до вакцинации, а также спустя 7, 15 и 45 дней исследователи брали у них пробы крови, чтобы выделить Т-лимфоциты и «прочитать» в них гены компонентов Т-рецепторов. В крови доноров обнаружили от 500 до 1500 вариантов Т-рецепторов, распознающих антигены вируса, передает научно-популярный портал «Чердак». При этом даже у однояйцевых близнецов набор ТКР существенно различался, однако ученые определили ряд закономерностей.
На их основе был разработан алгоритм, позволяющий предсказать, как меняется набор ТКР после вакцинации у каждого человека. После проверки алгоритма на неродственных друг другу людях оказалось, что он имеет высокую точность.
Авторы исследования убеждены, что данный способ предсказания набора ТКР к конкретному антигену поможет в диагностике инфекций и сделает их терапию более эффективной.
